Bedeutende Forschungsprojekte werden beispielsweise im Bereich der Krebsforschung, der Kardiologie, der Rettungsmedizin, der Psychologie und der Gastroenterologie durchgeführt. Auch bei der Erforschung des Coronavirus engagieren sich Wissenschaftler des Universitätsklinikums Minden. So kooperiert das Klinikum im UK-RUB-Verband bei verschiedenen Forschungsprojekten. Das Jahr 2020 wird von der Corona-Krise überschattet. Wichtig sei es nun, die Balance zwischen dem normalen Krankenhausbetrieb und der kurzfristigen Möglichkeit, viele Covid-Patienten gleichzeitig zu behandeln und zu beatmen, auszuloten. 

Fünf langfristige Ziele des Klinikums seie die Fortführung der Investitionen in den Neubau der Notaufnahme in Lübbecke, den Aufbau eines Zentrums für roboterassistierte Chirurgie am Krankenhaus Lübbecke, die Stabilisierung und Ausweitung des Leistungsangebots am Krankenhausstandort Rahden, die weitere Intensivierung des Forschungs- und Lehrbetriebs am Medizin Campus OWL sowie die Vorbereitungen für einen möglichen Krankenhausneubau in Bad Oeynhausen.