Für das Jahr 2013 erhält das UKE vom Senat staatliche Zuweisungen in Höhe von insgesamt 127,262 Millionen Euro als Globalbudget. Dieser bis zum Jahr 2020 zugesagte Betrag wird jährlich ab 2014 um ein knappes Prozent gesteigert. Im Globalbudget enthalten sind insbesondere alle Aufwendungen und Personalkosten für die kostenintensive Medizinerausbildung, die Aufwendungen für die biomedizinische Forschung und auch die Investitionsmittel. Nicht im Globalbudget enthalten sind die Mittel für Versorgungszuschläge. Die hierzu bereits bestehenden Regelungen bleiben durch die Vereinbarung unberührt.