Er war zuvor Abteilungsleiter Controlling/Medizincontrolling im Klinikum Berlin-Buch. Vorherige Station des gebürtigen Kielers war die DAMP Holding AG, wo er unter anderem von 2008 bis 2012 als stellvertretender Abteilungsleiter Konzerncontrolling tätig war. Jörg Wegener, der die letzten beiden Jahre als Klinikgeschäftsführer in Northeim tätig war, verlässt das Unternehmen auf eigenen Wunsch. Grund hierfür ist die unerwartet eingetretene Pflegebedürftigkeit seines Vaters an seinem Heimatort. Er wird dort die Leitung einer anderen Klinik übernehmen.

Helios ist der größte deutsche Klinikkonzern, zu dem 110 Akut- und Rehabilitationskliniken gehören.