Um in die Focus-Liste der „Top-Kliniken 2018“ aufgenommen zu werden, muss eine Abteilung über Jahre konstant exzellente Arbeit geleistet und sich unter Experten einen sehr guten Ruf erworben haben. Analysiert werden die Qualifikation der Spezialisten und Fachkräfte, die Patientenzufriedenheit und die Hygienestandards. Zudem werden Maßnahmen des klinischen Qualitäts- und Risikomanagements wie auch die technische Ausstattung erfasst. In die Wertung fließen ebenso Empfehlungen von mehr als 15 000 Fach- und Chefärzten ein.

In der Sonderausgabe Focus-Gesundheit, die am 4. Oktober 2017 veröffentlicht wurde, finden sich nicht nur die Top-100-Kliniken, sondern auch eine Sortierung nach Bundesländern und den Fachrichtungen Diabetes, Krebs, Psyche, Neurologie, Geburtshilfe, Herz und Orthopädie.