Matthias Kapischke tritt die Nachfolge von Gero Massenkeil an, der das Amt als Ärztlicher Direktor seit 2016 inne hatte und es nun turnusmäßig weitergibt. Der Ärztliche Direktor und sein Vize vertreten die Ärzteschaft im Klinikum Gütersloh und stehen innerhalb der Betriebsleitung im direkten Kontakt mit der Geschäftsführung, der Pflegedirektion und der Kaufmännischen Direktion. 

Kapischke ist Facharzt für Chirurgie, Viszeralchirurgie, spezielle Viszeralchirurgie und Proktologie und seit 2016 Chefarzt im Klinikum Gütersloh. Neben seiner Tätigkeit als Chefarzt ist er Leiter des von der Deutschen Krebsgesellschaft zertifizierten Viszeralonkologischen Zentrums, einem Zusammenschluss unterschiedlicher Fachabteilungen des Klinikums, niedergelassener Ärzte und weiterer Kooperationspartner zur Behandlung von bösartigen Erkrankungen und Tumoren des Bauchraums. 

Sein Stellvertreter Axel von Bierbrauer ist Chefarzt der Klinik für Innere Medizin III (Pneumologie, Schlaf- und Beatmungsmedizin, Infektiologie und Allgemeine Innere Medizin). Der Facharzt für Innere Medizin, Pneumologie, Infektiologie, Schlafmedizin, Internistische Intensivmedizin, Notfallmedizin, Angiologie und Labordiagnostik (fachgebunden) ist seit 2013 Chefarzt am Klinikum Gütersloh. Zudem leitet er das Zentrallabor des Klinikums.